出生于“圣女”世家的菲莉亚，由于从小接受斯巴达教育，拥有“历代最强圣女”的实力。
但是，由于她的表现太过完美，被认为“太过完美，一点都不可爱”，甚至被未婚夫第二王子尤里乌斯解除婚约——。
由于邻国没有圣女，菲莉亚被卖给邻国。
菲莉亚做好了在邻国遭受悲惨待遇的心理准备，但等来的却是意料之外的热烈欢迎……!?
不苟言笑的圣女被出卖后敞开心扉绽放笑容的奇迹幻想，开幕!
东京大决战结束，十年一晃眼就过去了，日本以地区为单位分裂成为了一个个小国家，各自为王。森友望未（小泽亚李配音）是自警团的新人研修生，无论是长相、个性或是成绩都中不溜秋的她在某一日突然产生了想要横跨日本列岛诸国的念头。说干就干，就这样，森友望未踏上了旅程。
性格内向有些还有的路痴少女小坂结季奈（日高里菜配音）、活泼开朗不拘小节的元气少女响逢衣（种田梨沙配音）以及身份神秘的虎牙少女御园千绫（花守由美里配音），一路上，森友望未结识了各种各样善良的同伴们。在领略沿途风景的同时，四个女孩亦背负起了维护和平的光荣使命。
在人们与风共度的城镇·风罗市，每年都会举行一次“风祭”。在祭典的最后一天，传说中的宝可梦·洛奇亚会出现，并带来恩惠之风——在这样的古老传说仍然流传之际，聚集在城镇的人们怀抱各自的心绪前去参加祭典……。
宝可梦的新手女高中生，莉莎。停不下说谎的吹牛男人，卡加奇。对自己没有自信的软弱研究家，托利托。厌恶宝可梦的古怪婆婆，翡翠。独自一人伫立于森林中的神秘少女，拉尔戈。
小智、皮卡丘与他们相遇，驱动起大家的故事——。
承受着残酷命运的少女露恩•芭洛特（林原惠美配音）与强敌鲍伊德（矶部勉配音）进行着实力悬殊的惨烈战斗，危急时刻，号称万能兵器的犯罪搜查官乌夫库克博士（八岛智人配音）出现，拯救了濒临死亡的芭洛特。当芭洛特再次醒来，发现自己正置身于传说中的禁忌科学诞生之地——“乐园”实验室，再次她见识了许多奇怪的发明，并了解到“乐园”和三博士的过去。经过一番追查，她终于得知榭尔（中井和哉配音）的记忆正藏在卡西诺赌场的一枚筹码之中。为了追查榭尔的过去，芭洛特化装成赌客走入凶险的赌场……
本片根据冲方丁的科幻小说改编，为“壳中少女”三部曲中第二部（另两部分别为“压缩”和“排气”）。