神崎瞳（坂本真绫配音）出生在难能可贵的和平年代，然而，日复一日波澜不惊的生活却让她感到厌倦至极，甚至失去了生活下去的希望。在一场意外中，瞳被传送到了名为盖亚的异世界中，在这里，人们要抵抗的是来自强大黑龙族的破坏和攻击。而唯一能够拯救这个世界的，是名为梵（关智一配音）的龙族后裔。
被传送到这个世界的瞳，见到了曾经在幻觉中出现过的龙之铠甲艾斯嘉科尼中，成为了人们眼中的救世主，背负上了拯救苍生的重任，而她和梵共同对抗的，竟然就是梵的哥哥。在激烈的交战中，瞳渐渐找回了活着的意义，而瞳的出现亦让一心求死的梵产生了活下去的勇气。
火风绀（江口拓也配音）是一个平凡的少年，某一天，绀竟然被召唤到了被称为“米拉”的异世界之中。刚刚来到米拉，绀就发现了被敌方袭击而几乎全军覆没的爱卡尔拉特公主（三上枝织配音）一行人，此刻，他们正遭到来自于邪恶教团的恐怖组织“因克古尼特”的攻击。在莫名其妙之中，绀打败了队长艾乐库（神谷浩史配音），解救了公主。作为报酬，公主将带领绀到达都城寻找回到原来世界的方法。
忠心耿耿的骑士森格伦（中井和哉配音），能文能武的侍女玛丽安戴尔（福山润配音），可爱的宠物佩特（细谷佳正配音），在这些同伴的陪伴下，绀踏上了前往都城的旅程。没想到，一路上危险如影随形，敌人不断骚扰，在这样恶劣的情况下，他们能够顺利到达终点吗？
在人与妖怪之间过着忙碌日子的夏目，偶然与以前的同学结城重逢，由此回忆起了被妖怪缠身的苦涩记忆。此时，夏目认识了在归还名字的妖怪记忆中出现的女性·津村容莉枝。和玲子相识的她，现在和独子椋雄一同过着平稳的生活。夏目通过与他们的交流，心境也变得平和。但这对母子居住的城镇，却似乎潜伏着神秘的妖怪。在调查此事归来后，寄生于猫咪老师身体的“妖之种”，在藤原家的庭院中，一夜之间就长成树结出果实。而吃掉了与自己形状相似果实的猫咪老师，竟然分裂成了3个——！？
长得像婴儿一样可爱的里包恩（西萩五十铃配音），真实身份其实是令人闻风丧胆的意大利黑手党杀手。他奉彭格列的第九代老大的命令，来到日本寻找彭格列的第十代老大沢田纲吉（国分优香里配音），并把他培养成合格的接班人。沢田纲吉外号废柴纲，就读于并盛中学一年A班，全科成绩平均17.5分，跳马只能跳三层，单杠向上翻转也不会，无论做什么事都不行的废柴。里包恩行为搞怪过激，让一向邋遢不求上进的纲头疼不已。但是里包恩通过必死弹，竟然让并盛中学的偶像笹川京子（稲村优奈配音）对一直默默无闻的纲产生了好感。纲慢慢开始接受里包恩的改造，过起了欢乐和恐怖的生活，并向黑手党首领一步步迈进。
故事发生在遥远的2061年，自然的破坏使得地球的环境变得十分恶劣，气温骤降大地冰封，在意大利图斯卡纳，居住着伽利略的后代三姐妹。叶月（真堂圭配音）个性奔放耿直，大大咧咧的她心怀着成为检察官的梦想。神月（大久保瑠美配音）个性冷淡沉默寡言，拥有极强运动神经的她其实在内心里十分的需要保护。星月（日高里菜配音）是个高智商少女，对机械颇为精通，三姐妹中要数她的性格最为温柔可人。
一次偶然中，三姐妹遭到了陌生人的突然袭击，而袭击者的目标只有一个，那就是得到传说中的“伽利略的遗产”，可是，对于这笔遗产的存在，三姐妹一无所知。为了不让宝贵的遗产落入坏人手中，本性个性迥异而不合的三姐妹决定合作。
4月2日，全新的游戏王动画始动！讲述18岁新主角集齐6（原五张）龙卡的全新故事！武藤游戏的时代数十年后的童实野町，演变成了阶级社会的未来都市——新童实野市。主人公不动游星驾驶着决斗盘的进化型D轮摩托以从下层区到上层区为目标奔驰。以夺走对自己和朋友很重要的卡星尘龙的为所欲为的竞敌·骑乘决斗的冠军人物杰克·阿特拉斯所在的决斗竞技场为目标，终于游星和杰克对峙了。怀着各自的坚定信念的他俩的王牌怪兽——星尘龙与真红魔龙展开激烈冲突！在二龙之战中忽然出现的神秘红龙，让游星的手臂浮现出了龙之印。由龙之印所引导的各自的命运在这一刻开始了。到底为朋友而战的游星前面等待着他的会是什么？龙之印所带来的到底又是什么呢？时代是游戏王GX后的几十年。决斗盘进化！骑乘决斗大为流行！在5D'S的时代，结合了摩托竞速与卡片游戏的竞技骑乘决斗，以骑乘型最新决斗盘D轮进行的高速感决斗十分流行，让观众也跟着狂热起来！新怪兽陆续登场！新动画当然也是充满各种决斗场面！从没见过的怪兽们正极度活跃之中。游戏王5D’S的卡片也有所不同了：新规则中白色同调怪兽卡追加！这次的新规则中添加了一种名为同调怪兽的白色卡片，能力：放在额外卡组，如果场上的对应协调怪兽和其他怪兽的等级合计与同步怪兽的等级吻合可以特殊召唤。 卫星区篇 以武藤游戏所在时代数十年后的童实野市为舞台。那时的童实野市被称为“新童实野市”，是一个根据身份高低分为上层地带和下层地带的阶级社会，流行着使用被称为“D轮（DWheel）”的摩托车型决斗盘决斗的“骑乘决斗（RidingDuel）”。不动游星在新童实野市的下层地带“卫星区（Satellite）”中与同伴们一起生活着。因被对手——骑乘决斗的KING“杰克·亚特拉斯”偷走了自己最重要的卡“星尘龙（StardustDragon）”，为了把它夺回，游星逃出了卫星区。 DuelofFortuneCup篇 再会后的游星与杰克在Stadium进行了骑乘决斗。在白热化的战斗展开途中，两人的手臂突然出现了印记，最后伴随着双方的王牌龙互相攻击，神秘的红龙出现了。得知此事的治安维持局长官雷克斯，将游星的同伴捉走作为人质，强迫他参加优胜者可以获得向KING杰克的挑战权的“DuelofFortuneCup”大赛。在这个大赛里被雷克斯吸引过来的游星、超能力决斗者十六夜亚纪、天才决斗少女龙可、还有杰克4人、都觉醒为“红龙的龙印者”，最后获得优胜的游星在与杰克的决斗中获得了胜利，成为了新的决斗王。 暗印者篇 原来FortuneCup是歌得温为了集合龙印者所举办。另一方面，一群名为“暗印者”的决斗者已经蠢蠢欲动，他们能够展开会令决斗者受到真实伤害的“黑暗决斗”，以及使用一种叫“黑暗同步”的新战法，以及在背后控制他们的“地缚神”。游星以建造连接卫星区和都市区的代达罗斯桥为条件，前往卫星区阻止“暗印者”的计划。 WRGP篇 与“暗印者”之战半年后，连接卫星区和都市区的桥梁终于完成，彼此的界线总算消失。全市还建造了大量专为骑乘决斗而设的高速公路，还开发了高速世界2取代以前的高速世界，世界大赛“WRGP”开幕在即，游星等人组成“5D'S队“参赛。然而，新的威胁已经悄悄地来临——神秘组织“太一”的三皇帝出现，使用可以吸收同步怪兽的“机皇帝”欲图毁灭童实野市，市区上空不时浮现不祥的黑影。双方在大赛决战相遇，这场战斗的胜负将决定童实野市的存亡。 弧线摇篮篇 虽然阿波利亚被打败，带来毁灭的黑影正体”弧线摇篮“还是出现了，童实野市危在旦夕。而主使这一切的”Z-ONE（忘-我）“也终于浮出水面，来自被破灭未来的他要毁灭灾祸的肇源童实野市改变未来。游星等人不能认同他的做法，登上”弧线摇篮“与”Z-ONE“展开最后的决战。最终，Z-ONE被游星击败，弧线摇篮消失，游星拯救了童实野市，平安归来。 后日谈 Z-ONE被打败数年后游星等人的故事。 副注 现在看到的故事剧情是在Z-ONE介入改变历史后的情况。原本的历史到暗印者就是最终BOSS，没有WRGP存在。之后游星与同伴参加各种国际大赛，在不断的磨炼中领悟“CLEARMIND”、加速同步、三角加速同步，成为将人类领向进化新时代的传奇人物。但在未来人类因为过快进化滥用同步而恶欲膨涨，招来毁灭。Z-ONE为改变介入了过去改变了历史，故事才有了现在的情况。
新学期开始，各个社团都在大力招新，青春学园的强势社团网球社迎来了一位从美国回来的新生越前龙马（皆川纯子配音）。个头虽小气场却不小的龙马寡言少语性格颇拽，引来了前辈们的不满。但一经较量后，发现龙马果真实力非凡，虽然是一年级，但还是入选为正式队员，目标直指全国大赛。 而网球社的成员也都各有各的本领和个性。总是笑眯眯的不二（甲斐田雪配音）、爱操心的大石（近藤孝行配音）、龙马的好友桃城（小野坂昌也配音）、桃城的死对头海棠（喜安浩平配音）、闹腾的菊丸（高桥广树配音）、数据控的乾（津田健次郎配音）以及实力强劲的队长手冢（置鲇龙太郎配音）。性格各异的他们在磨合中逐渐形成默契，一路征战，遇见形形色色的来自其他学园的挑战，而大家的目标只有一个，那就是全国大赛的冠军。
樋口健太郎（泽城美雪配音）的双亲在幼年时因车祸而去世，性格内向沉默寡言的他在学校里并不活跃，唯一的好友便是外表帅气成绩优秀的绫小路天（斋贺弥月配音）。某日，一个叫做美纱（田村由里香配音）的女孩出现并改变了健太郎的生活，她住在健太郎的隔壁，性格活泼又开朗，而她的真实身份，居然是实习天使。 美纱的开朗渐渐的感染了健太郎，而此时，外表可爱的实习恶魔紫亚（野上由加奈配音）也来到了人间。个性迷糊的她失去了自己的记忆，寻找这段记忆，即是她此行最大的目的。健太郎和他的天使朋友们度过了一段有笑有泪的美好生活，然而，令他想不到的是，转眼间，注定的分别就已经来到了眼前。
故事发生在遥远的二零二零年，在同神秘生物“原肠动物”的战争中，人类首次尝到了彻底失败的滋味，土地被剥夺，权利被压榨，在冷酷的独裁统治之下，人类被迫过起了苟且偷生的压抑生活。然而，即便如此，坚强的人们仍然没有放弃反抗的机会，为了对抗强大的敌人，“天童民间警备公司”成立了。
表面看来，里见莲太郎（梶裕贵配音）只是一介平凡的十六岁告众人，可实际上，他年纪轻轻就已经成为了“民警”中的一员，在搭档蓝原延珠（日高里菜配音）的帮助下，莲太郎决定要找到莫名死亡的父母的真正死因。一个绝密任务的出现将莲太郎带往了巨大谜团的中心，在危险和杀戮之中，他最终会得到怎样的真相？
令人忌惮而又好奇的黄泉幽冥界，轮回抵偿，善恶果报，一一得到判明。随着人口的大爆炸，前往阴曹地府的鬼魂也越来越多。冥司事务繁忙，坐镇中央的阎魔大王（长嶝高士配音）自然不可小觑，而堪称左膀右臂的第一辅佐官鬼灯（安元洋贵配音）更是令冥府上下都忌惮恐惧的超S级人物。他外表冷峻，不苟言笑，甚至对阎罗大王都敢出口不逊。恐怖森然的无间地狱，作恶之徒饱受罪业折磨。鬼灯大人虽然震慑感十足，却也和各种脱线的伙伴们无意中制造了不少的笑料和乐趣。上至天堂，下到龙宫，神道、鬼道、佛道、仙道、妖道、人道，圣者与众生的大聚会，欢乐层出不穷……
本片根据江口夏实的原作漫画改编。